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本文目录一览：

• 1、【分子对接】AutoDock
• 2、做安卓软件开发需要哪些工具?
• 3、linux怎么搭建android开发环境

【分子对接】AutoDock

1、第一步：准备分子PDB文件。小分子使用chemdraw软件画图，保存为.sdf格式，再用chemdraw3D调整至.pdb格式。大分子下载自rcsb网站，去除溶剂和小分子。第二步：将PDB文件转换为PDBQT格式。通过AutoDockTools-6软件，完成氢原子添加、电荷计算、原子类型设置和输出。第三步：创建GLG文件。

2、Autodock是一款开源的分子对接软件，其最新版本为AutoDock 6，包括AutoDock和AutoGrid模块，可从autodock.scripps.edu获取下载。对于初学者，我们将在本文中指导如何使用Windows 7系统进行半柔性对接，以蛋白酶1YT9的晶体结构和配体IOS为例。

3、软件下载：获取并安装AutoDock Vina。蛋白及小分子准备：提取纯净蛋白单体结构。分子对接：设置对接盒子，选择小分子进行对接，保存对接盒子为gpf文件。运行对接盒子：使用autogrid工具进行预处理，然后运行对接。设置对接参数：使用LamarkianGA参数进行对接。

4、Autodock分子对接过程分为蛋白和小分子预处理、正式对接、结果分析及注意事项四个步骤。首先，预处理是关键。小分子预处理需从ZINC或TCMSP获取mol2格式，用pymol转换为pdb，进行氢化、电荷计算并指定为对接分子，最后导出pdbqt格式。

做安卓软件开发需要哪些工具?

首先，集成开发环境（IDE）是安卓开发中最重要的工具之一。IDE为开发者提供了完整的开发环境，包括代码编辑器、编译器、调试工具等。Android Studio是最流行的安卓IDE，它由Google官方发布并支持，具备代码提示、智能重构等高级功能，帮助开发者高效编写代码。其次，SDK工具包也是开发过程中不可或缺的一部分。

首先，你需要一个集成开发环境（IDE），Android Studio是官方推荐的开发工具，它集编码、调试和模拟器工具于一体。其次，掌握Java编程语言是必不可少的，因为安卓应用主要用Java编写。接着，Android SDK是一组开发工具、库和模拟器，提供丰富的API和类，用于构建各种功能。

App Inventor 是谷歌推出的一款简单易用的 Android 应用开发工具。它的用户界面直观，使得新手能够快速上手，轻松制作 Android 应用。 应用公园 应用公园是国内领先的 App 制作平台，与传统的开发工具不同，它使得非技术人员也能够制作专业的 App。

Eclipse with ADT 虽然Android Studio是目前的主流选择，但Eclipse曾经也是一款非常流行的Android开发工具。Eclipse是一个通用的IDE，而ADT（Android Development Tools）是一个插件，为Eclipse增加了Android开发的支持。然而，随着Android Studio的推出和不断完善，Eclipse的使用率已经大幅下降。

BiznessApps软件开发工具 这是一块专门为中小企业提供的一个快速制作手机APP应用软件的平台。它目前支持的开发平台有IOS（含iPhone和IPad）、Android这两，开发者可以直接在这个平台上制作IOS和安卓的app应用。

AndroidStudio AndroidStudio是是基于IntelliJIDEA的谷歌开发Android应用开发集成开发环境(IDE)。有IntelliJ的代码编辑器和开发者工具。AndroidStudio拥有很多可以提升安卓app开发效率的功能。

linux怎么搭建android开发环境

1、目前官方推荐开发环境是eclipse+ADT。当然你完全可以采用其他任何一种开发环境，但是我还是选择了官方的推荐，因为一切都是免费的。下载eclipse的地址是：http：//我下载的是32bit linux ：Eclipse IDE for Java Developers。

2、第一步：安装JDK。要下载Oracle公司的JDK可以百度“JDK”进入Oracle公司的JDK下载页面，选择自己电脑系统的对应版本即可。第二步：配置Windows上JDK的变量环境 。JAVA_HOME 先设置这个系统变量名称，变量值为JDK在电脑上的安装路径：C：\Program Files\Java\jdk0_20。

3、下载android studio 0，这个版本不带sdk，所以安装完毕后，需要在android的studio中下载sdk。文件下载完成后，可以看到是一个.zip文件，直接解压提取文件，然后在/android-studio/bin中可以看到有一个文件叫做“studio.sh”，这个文件就是android studio的可执行文件，相当于windows中的.exe文件。

4、Android Studio 是谷歌提供的 Android 开发集成开发环境（IDE），适合替代带 ADT 插件的 Eclipse。本指南将指导如何在 Ubuntu 104 和 104，以及相应版本的 Linux Mint 上安装 Android Studio。首先，确保在 Ubuntu 上已经安装了 Java。

5、在Windows系统中配置Android开发环境时，首先需要安装JDK并配置环境变量。接着，可以下载Eclipse并解压使用。安装Android SDK需要解压后运行更新，这个过程可能会比较缓慢。安装ADT可以选择下载安装包或通过网络安装，具体步骤是打开Eclipse的帮助菜单，然后选择install new software。