linux系统openmpi安装教程 linux如何安装openssl
本文目录一览:
- 1、linux下怎样安装openmpi
- 2、OpenFOAM-5.x+LIGGGHTS-3.8.0+CFDEM在CentOS7.9上的安装(上)
- 3、两小时入门MPI与并行计算(二):MPI的安装与配置
- 4、BLAS库和LAPACK库的安装(Linux系统)
- 5、在linux下搭建intel-mpi,可以在个人笔记本上实验么
linux下怎样安装openmpi
首先进行解压文件openmpi-tar.gz。
首先,确保编译器(如gfortran或ifort)已安装,这是进行Fortran编程的关键。接下来,选择要安装的MPI库,可以通过访问MPICH或OpenMPI官网获取。解压并建立安装目录,注意选择与编译器对应的用户目录,避免混淆。配置安装路径和编译器选择。
安装步骤相对常见,但对初学者可能有挑战。首先,确保已安装必要的编译器,如gcc。使用which命令检查其路径,如果没有,需要安装并设置环境变量。从mpich.org下载适合的版本,通过tar命令解压,然后使用./configure进行配置,指定安装路径。编译过程中可能出现的错误,如编译器问题,通常通过升级编译器来解决。
对于在特定Linux环境下离线安装OpenMPI的需求,由于无法通过外网连接,需要使用docker容器进行安装。推荐OpenMPI版本为0.4,但容器内可能显示为旧版本。因此,需要在容器内部独立安装OpenMPI。具体步骤包括下载已编译的OpenMPI源码包,将其解压缩至容器内,然后配置编译参数并执行编译安装过程。
OpenFOAM-5.x+LIGGGHTS-3.8.0+CFDEM在CentOS7.9上的安装(上)
1、在完成上述准备工作后,即可进行OpenFOAM的编译安装。这一步骤包括设置环境变量、下载并解压OpenFOAM-x和ThirdParty-x的源码,以及使用bash脚本来自动完成编译过程。
2、首先,安装必需的依赖包,包括gcc、g++、Make、kernel-devel等,可以通过在终端输入命令查看gcc版本,并确保使用gcc-5版本,适用于OpenFOAM-x、LIGGGHTS以及CFDEM。对于个人用户,使用sudo yum -y install安装依赖包,而对于CentOS集群用户,可从pkgs.org下载rpm包并通过rpm -ivh命令安装。
两小时入门MPI与并行计算(二):MPI的安装与配置
1、安装步骤相对常见,但对初学者可能有挑战。首先,确保已安装必要的编译器,如gcc。使用which命令检查其路径,如果没有,需要安装并设置环境变量。从mpich.org下载适合的版本,通过tar命令解压,然后使用./configure进行配置,指定安装路径。编译过程中可能出现的错误,如编译器问题,通常通过升级编译器来解决。
2、首先,安装MPI:在你的计算机上,可以通过命令行安装MPI,如需C代码示例,我已经准备了一个名为mpic的文件,你可以使用mpicc编译器进行编译。在虚拟机中,MPI可能不会自动利用多核,因为默认配置可能只有一个处理器。
3、首先,确保编译器(如gfortran或ifort)已安装,这是进行Fortran编程的关键。接下来,选择要安装的MPI库,可以通过访问MPICH或OpenMPI官网获取。解压并建立安装目录,注意选择与编译器对应的用户目录,避免混淆。配置安装路径和编译器选择。
BLAS库和LAPACK库的安装(Linux系统)
第一步是下载安装包,以0版本为例,可从官网下载或通过链接下载。下载后的压缩包为 tgz 格式。随后创建新文件夹并解压安装包。解压后进入文件夹,使用 vim 打开 make.inc.example,并将倒数第4行的配置进行修改。保存退出后,执行编译命令。
Linux系统下,若需进行高效且便捷的BLAS和LAPACK库安装与使用,推荐选用Intel的MKL库。本文将对MKL库的使用进行实例展示,并概述BLAS、LAPACK、CBLAS与LAPACKE库的安装与配置。
具体来说,需要修改SLmake.inc的29到33行和57到60行,将gfortran、blas和lapack的路径替换为你实际安装的库路径。使用make命令编译,无错误则安装成功。编译完成后,将生成的libscalapack.a文件复制到/home/xxx/usr/lib目录下完成安装。
lapack是以blas为基础的,所以安装lapack后,也会安装好blas。之前在ubuntu下用新立得安装lapack,之后再安装phg时可以自动识别出BLAS/LAPACK库,而在centos下通过yum install 安装lapack后,phg在配置时不能识别出BLAS/LAPACK库,只能从LAPACK官网下载源码自己进行编译。
lib: lapacklib tmglib lib: blaslib variants lapacklib tmglib 然后打开终端,切换到当前目录,输入:sudo make 即可。操作到这里没有报错。然后把文件夹下面的liblapack.a,librefblas.a,libtmglib.a 三个库拷贝到/usr/lib。
在Ubuntu系统上安装了CMake作为构建工具,用于管理和生成用于编译程序的构建脚本。通过配置CMakeLists.txt文件并执行CMake命令生成构建脚本。安装了Intel MKL BLAS库,使用命令行下载并配置环境变量。遇到与intelpython的冲突时,通过修改配置文件解决。
在linux下搭建intel-mpi,可以在个人笔记本上实验么
1、使用intel-oneAPI编译器+MKL数学库+intelmpi实现MPI+openmp支持多线程,特别注意注释部分的内容。并行编译gam、std、ncl三个版本。对于非Intel平台,可优化和注意以下事项。完成编译后,生成的可执行文件位于特定目录。
2、安装部署Intel oneAPI,具体可参考blog.csdn.net/u013206..。加载编译依赖环境后,解压安装。在该路径下有常用各类编译器配置的makefile文件,本次以intel+intelmpi为例。编译配置参考。针对非intel平台优化和注意事项,修改Makefile.mpi内容:去掉-xHost -qopt-zmm-usage=high,添加-march=haswell。
3、每个部分的配置命令都需要根据具体环境进行调整。在安装实例1中,如果选择下载并安装MPI,配置命令如下,而基础配置只需前几行。配置完成后,通过make和check进行构建和测试,最终的PETSC库会调用内部的mpi。在实例2中,如果使用已安装的MPI和Intel的MKL库,配置命令有所不同,需要额外安装metis和parmetis。
4、可以看出MPI并行本身的确占用了海量内存,几乎总内存占用量的一半都是MPI本身占用的。检查程序是否存在内存泄漏。MPI模式的valgrind显示在调用的MPI calls中存在memory lost,鉴于Intel MPI的广泛使用,认为这是false positive。valgrind没有找到程序中的内存泄漏。
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